Nature Methods 2021年12月文章目錄
Resources
1.標題：用於(yu) 探索遺傳(chuan) 和藥物擾動的3D結構SARS-CoV-2-人類相互作用組
簡介：這種三維結構的SARS-CoV-2-人類相互作用組web server允許對 SARS-CoV-2 病理學和宿主反應的機製進行假設驅動的探索。
作者：Shayne D. Wierbowski, Siqi Liang...Haiyuan Yu
原文鏈接：https://www.nature.com/articles/s41592-021-01318-w
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Brief Communications
1.標題：Micro-Meta App：一種基於(yu) comminity規範收集顯微鏡元數據的交互式工具
簡介：Micro-Meta App 是一種直觀、高度可互操作的開源軟件工具，旨在促進最近community指南指定的相關(guan) 顯微鏡元數據的提取和收集。
作者：Alessandro Rigano, Shannon Ehmsen...Caterina Strambio-De-Castillia
原文鏈接：https://www.nature.com/articles/s41592-021-01315-z
2.標題：OME-NGFF：用於(yu) 擴展生物成像數據訪問策略的下一代文件格式
簡介：OME的下一代文件格式 (OME-NGFF) 為(wei) OME-TIFF 和 HDF5 提供了雲(yun) 原生補充，用於(yu) 大規模存儲(chu) 和訪問生物成像數據，並致力於(yu) 實現可查找、可訪問、可互操作和可重複使用的生物成像數據的目標。
作者：Josh Moore, Chris Allan...Jason R. Swedlow
原文鏈接：https://www.nature.com/articles/s41592-021-01326-w
Articles
1.標題：細菌基因調控的持久性和可塑性
簡介：介紹了生物素-DNA 親(qin) 和純化 (DAP) 測序，即一種用於(yu) 分析轉錄因子 (TF) DNA 結合的體(ti) 外無克隆工作流程，以及用於(yu) 同時表征多個(ge) 細菌基因組中TF DNA 結合的multiDAP。
作者：Leo A. Baumgart，Ji Eun Lee...Ronan C. O’Malley
圖：
2.標題：繪製單細胞水平細胞係統發育圖揭示器官發育過程中的細胞群體(ti) 動態
簡介：SMALT 是一種堿基編輯譜係追蹤方法，可在單細胞水平進行全器官發育分析。
作者：Kehui Liu, Shanjun Deng...Xionglei He
3.標題：使用pGlyco3對完整糖肽和修飾多糖進行精確、快速和全麵的分析
簡介：pGlyco3是一種多糖優(you) 先的糖肽搜索引擎，用於(yu) 識別和定位位點特異性N-和O-糖肽，包括帶有修飾多糖的糖肽。
作者：Wen-Feng Zeng, Wei-Qian Cao...Peng-Yuan Yang
4.標題：光譜熵在小分子化合物鑒定方麵優(you) 於(yu) MS/MS點積相似性
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5.標題：使用分級相襯層析成像技術對具有細胞結構局部分辨率的完整人體(ti) 器官進行成像
簡介：分級相襯層析成像(HiP-CT) 能夠對完整人體(ti) 器官內(nei) 的任何區域進行多尺度成像，直至細胞分辨率。五種器官類型的HiP-CT揭示了健康和患病組織的3D形態特征。
作者：C. L. Walsh，P. Tafforeau...P. D. Lee
原文鏈接：https://www.nature.com/articles/s41592-021-01317-x
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6.標題：使用改造黃熱病疫苗YFV-17D進行順行跨神經元追蹤和遺傳(chuan) 控製
簡介：使用黃熱病疫苗YFV-17D的改造變體(ti) 可以實現順行跨神經元追蹤。單突觸和多突觸追蹤都在小鼠大腦的不同回路中得到證實。
作者：Elizabeth Li, Jun Guo...Wei Xu
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