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Nature methods : 生物動力學實時多角度投影成像

發布時間:2022-04-29 16:29:23 瀏覽量:4524 作者:LY.Young 光學前沿

摘要

定量生物成像需要在空間和時間上都滿足Nyquist采樣要求。然而,目前基於(yu) 激光掃描和相機記錄的顯微鏡,不適合從(cong) 三維的角度觀察快速變化的生物活動。因為(wei) 這些活動變化之快,遠超基於(yu) 激光掃描和相機記錄顯微鏡的三維采集幀率。

正文


Nature methods : 生物動力學實時多角度投影成像



技術背

定量生物成像需要在空間和時間上都滿足Nyquist采樣要求。然而,目前基於(yu) 激光掃描和相機記錄的顯微鏡,不適合從(cong) 三維的角度觀察快速變化的生物活動。因為(wei) 這些活動變化之快,遠超基於(yu) 激光掃描和相機記錄顯微鏡的三維采集幀率。


當前不足:

當前的三維體(ti) 積信息采集方式,通常是沿z軸序列記錄數十至數百個(ge) 二維焦平麵的數據。現有的通過在一次柵格掃描或者一次曝光的時間內(nei) 同時記錄多個(ge) 二維焦平麵的方法,雖然可以提升1個(ge) 數量級的三維體(ti) 積信息采集幀率,但是通常以犧牲橫向分辨率為(wei) 代價(jia) ,並且還需要特殊的裝置,成像時也隻有沿光軸一個(ge) 方向的投影。對於(yu) 稀疏分布的簡單生物樣品,一個(ge) 方向投影是足夠的。但是對於(yu) 複雜的生物樣品,我們(men) 需要從(cong) 多個(ge) 方向的視角觀測樣品獲取更多的信息,才能夠重建樣品的三維體(ti) 積分布。但是多視角需要旋轉樣品或者多個(ge) 采集光路,這種方式在實際国产成人在线观看免费网站中不一定有條件實現。


文章創新點:

美國德克薩斯大學的Bo-Jui Chang(第1作者)和Reto Fiolka(通訊作者)提出一套結構簡單的掃描模塊,這套模塊可以嵌入目前的基於(yu) 相機記錄的顯微鏡(需要具備光學切片成像功能,即不接收焦平麵外的熒光信號)。由此組成的新的顯微鏡成為(wei) 一個(ge) 投影成像係統,可以將多個(ge) 不同的投影視角信息積分記錄。具體(ti) 實現是將不同的切片(對應不同的z軸位置)以不同的視角投影在相機上,所有視角在一個(ge) 相機幀內(nei) 記錄完。即一個(ge) 相機幀記錄所有Z軸信息。數據量大大減少,成像速度提升百倍以上。通過同時多角度成像的方法還可以實現實時三維成像和粒子定位。


原理解析:

(1)作者所提模塊的工作原理類似於(yu) 計算機視覺領域的錯切變形變換(shear-warp transform)。圖1a描述在同一個(ge) 體(ti) 積空間有多個(ge) 不同形狀的物體(ti) ,頂部表示體(ti) 積空間的錯切變換,中間表示體(ti) 積空間的旋轉變換,底部表示體(ti) 積空間投影圖。當投影方向一致時,錯切變換和旋轉變換後的體(ti) 積空間投影一樣(需要做一些簡單的縮放操作)。圖1b、c、d描述常規的z軸切片掃描獲得三維體(ti) 積信息。圖1e、f、g描述加上掃描投影模塊後z軸方向的切片以錯切的形式記錄在單個(ge) 相機幀上。




DOI:https://doi.org/10.1038/s41592-021-01175-7


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